ЛОКУС D
Гены этого локуса оказывают влияние на распределение гранул пигмента. Доминантный ген D отвечает за интенсивное прокрашивание шерсти, а рецессивный ген d – за ослабление пигментации. Порядок доминирования D >d. В нормальной пигментной клетке специальные транспортные белки снуют как рабочие муравьи, постоянно и непрерывно доставляя готовые гранулы из клеток непосредственно в шерсть. Результат работы гена D, руководящего одним из этих белков,  - интенсивно окрашенная в чёрный или коричневый цвет шерсть. Но если руководить процессом берётся ген d, то «транспортёры» начинают вести себя исключительно бестолково: то они медлительны и неповоротливы, то вообще останавливаются, то вдруг начинают лихорадочно тащить сразу большое количество гранул. В итоге часть пигментных гранул останется лежать в клетке «мёртвым грузом», остальные гранулы распределяются в шерсти весьма неравномерно, иногда «слипаются», образуя комки пигмента. В результате этого, для человеческого глаза шерсть будет выглядеть серо-голубой или в случае исходного коричневого пигмента, как лиловая (изабелловая). Также ген d производит ослабление пигментации кожи. Оказывает ли ген влияние не только на чёрный пигмент, но и на рыжий – вопрос спорный и по этому поводу есть различные мнения. Если и оказывает, то влияние это настолько незначительно, что им можно пренебречь. В качестве подтверждающего примера можно привести случаи, когда у собаки одновременно есть и голубой, и достаточно интенсивный рыжий пигмент: палевый с голубой маской, голубо-тигровый, голубой с подпалом. В большинстве этих случаев рыжий цвет хоть и не бывает насыщенным, но и не осветляется до кремового. Блеклый, невыразительный рыжий получается не столько из-за разрежения гранул жёлтого цвета, а в связи с изменением цвета примеси. В тех же случаях, когда одновременно осветлён и рыжий цвет, объяснения этому следует искать в присутствии совсем другого гена, регулирующего интенсивность рыжего пигмента, а именно – гена С.

ЛОКУС G
Гены G>g. Благодаря действию доминантного гена G происходит прогрессирующее поседение шерсти. Рецессивный ген  g  - отсутствие прогрессивного поседения. Щенки, имеющие ген G рождаются интенсивно окрашенными, но в возрасте нескольких недель окрас начинает изменяться. Особи чёрного окраса становятся серо-голубыми, коричневые – изабелловыми, а серые и изабелловые щенки осветляются практически до белого. То есть ген  G действует аналогично гену d лишь с той разницей, что механизм ослабления окраса сключается чуть позже и животные светлеют на протяжении всей жизни. Ген G ослабляет только черный пигмент. В качестве примера можно привести породу йоркширский терьер – осветлённый до голубо-стального цвета чепрак сочетается с интенсивно-золотистым цветом рыжеокрашенных волос. Если наблюдается одновременно также и осветление рыжего пигмента, то и в этом случае следует искать ответ в работе других генов.

Локус S
Локус белой пятнистости включает в себя несколько генов. Как и в случае с локусом С, точное количество рецессивных аллелей в локусе не известно, и мы имеем дело с условноё разбивкой пятнистых окрасов на категории, в зависимости от площади белых отметин.
Наиболее доминантный ген локуса S – отсутствие белых пятен.  Ген – ирландская пятнистость. Собаки с генотипом si имеют белые пятна на груди (от небольших с 10-копеечную монету, до обширных, захватывающих плечи), лапах, морде, узкий воротник на шее. Ген sp  - пегий окрас. Собаки с генотипом имеют большее количество белого, чем животные предыдущего типа. Ген sw – распространение белого практически на всю собаку. Кроме особей чисто белого окраса к данному типу относят и собак, имеющих одно-два небольших пигментированных пятна. Порядок доминирования - S > si > sp > sw.
Каким же образом действует этот ген и как удаётся всего лишь трём рецессивным аллелям обеспечить такое многообразие пятнистых окрасов, не допустив ни единого повтора, - окрас каждоё пятнистой собаки уникален, как отпечатки пальцев у человека.
Для начала уточним, что белый окрас не самом деле никакой не окрас, а отсутствие какого-либо окраса, вернее – отсутствие пигмента в шерсти собаки. Происходит это оттого, что те самые заводики-меланоциты просто не успевают сформироваться, а, следовательно, не вырабатывают пигмент, на который генетически запрограммирована данная особь.
Формирование пигментных клеток проходит на эмбриональной стадии и совершенно естественно, что происходит  это не в одно мгновение, а весь процесс пролонгирован во времени. Начинается жто на манер извержения лавы из жерла вулкана, роль которого выполняют первичные точки пигментации, расположенные возле ушей, глаз и на крупе у основания хвоста. Затем процесс распространяется на туловище, голову, конечности (сверху вниз), хвост (от основания до кончика). В последнюю очередь образование пигментных клеток происходит в области шеи (воротник, кончика хвоста, пальцев) и заканчивается на груди, стягиваясь в одну точку до полного окончания «покрытия территории». Многие заводчики имели возможность наблюдать конечную стадию этого процесса – некоторые щенки рождаются с небольшим белым пятнышком на груди, но с каждым днём это пятнышко становится всё меньше и меньше и, наконец, совсем исчезает – это последняя порция клеток наконец-то заняла свои места и включилась в работу. На фотографиях, изображающих представителей разнообразных пород можно проследить в какой последовательности происходит распространение пигмента. Вначале это единичные небольшие пятна. Далее – обширные пятна на голове и верних поверхностях тела. Затем практически полностью пигментированные верхние поверхности тела.  Далее небольшое пятно на груди. И наконец – полностью пигментированная особь.
Миссия генов серии S как раз и заключается в контроле над длительностью данного процесса. Доминантный ген S подаёт сигнал отбоя лишь тогда, когда вся работа выполнена на совесть. Следующий в табели о рангах ген  si, приостанавливает формирование меланоцитов, незадолго до окончания, оставляя, таким образом, незначительные «недоделки». Ген sp бросает работы на полпути, а sw и вовсе трубит отбой, ещё даже и не начав трудиться.
Достаточно просто объяснить и уникальный рисунок каждого пятна. Предлагаю провести следующий эксперимент: на белую скатерть вылить в нескольких местах красящую жидкость. Пятна обязательно получатся разного размера и формы. То же самое происходит и при распространении пигментной зоны, причём, в отличие от ровной поверхности стола, каждый щенок имеет уникальные рельеф и рисунок кожи.
Но далеко не всегда белое пятно на груди (или в другом месте) связано с наличием в генотипе гена si. В некоторых случаях это является следствием влияния негативних факторов на стадии эмбрионального развития.